2022 AI 대학원 챌린지

LG | 채용 | B-cell | Epitope | Classification | macro-f1

Prize : 총 2,500만원
311명 마감

Practice

Overview Data Code (share) Talk Leaderboard

Submission

RAI LAB 0.7311 코드 공유 (AAC 및 Peptide 클러스터링 피쳐 + 앙상블)

신한고양이

공동작성자

2022.07.31 20:14 1,861 Views language

저희 팀 코드 공유합니다!

전체적인 접근은 molecular weight, hydrophobicity 등의 펩타이드 피쳐를 가지고 클러스터링 피쳐를 만들어 추가해보는 방식이었습니다.

모델은 RF, XGB, GB, LGBM, CAT 을 사용했고 Soft Voting 해서 결과 도출 했습니다.

+ feature importance plot 추가합니다.

column 6 (cluster 2) 가 가장 높게 나왔습니다.

column 0 ~ 3 는 각각 assay method technique, assay group, disease type, disease state 이고
column 4는 length feature,
column 5~6는 cluster1, cluster2 feature,
cloumn 7 ~ 26는 AAC feature 입니다.

PDF

Code