baseline ncf를 수행하시면, train.csv에서 rating 컬럼을 제외한 모습처럼 결과가 나오는 것이 정상입니다.
혹시 코드에서 별도의 수정은 없었을까요?

혹시 recommend 함수의 하단부를 다음 코드로 교체 후에도, 같은 문제가 발생하는지 확인 부탁드립니다.

def recommend():
....

 submit = pd.DataFrame(columns=["user_id", "item_id"])
    user_list, item_list = [], []
    for user, rec in tqdm(pred.items()):
        user = parser.user_decoder[user]
        for item in rec[0]:
            item = parser.item_decoder[item]
            user_list.append(int(user))
            item_list.append(int(item))
    submit["user_id"] = user_list
    submit["item_id"] = item_list
    return submit

안녕하세요 데이콘입니다.
위의 KDD님의 안내와 같이, NCF 베이스라인 코드에서 추론 부분의 recommend 함수 중
for item in rec: 부분을 for item in rec[0]: 로 수정하시면 올바른 결과를 얻을 수 있습니다.
해당 내용은 NCF 베이스라인 코드에 수정하여 반영하였습니다.
감사합니다.