제1회 신약개발 AI 경진대회

데이터에 대한 도메인 기반 질문

2023.09.18 18:14 1,033 조회

늘 좋은 대회 감사합니다.

HLM, MLM 산식을 보면,

  1. 초기 화합물 농도 (C_initial): 반응 시작 시의 화합물 농도
  2. 30분 후 화합물 농도 (C_30min): 30분 후의 화합물 농도 (LC-MS/MS로 측정)

안정성 (%) = (C_30min / C_initial)×100

인데요,

초기 화합물 농도에 따라 같은 물질도 대사 속도에 영향을 줄 수 있다고 생각합니다.

이로 인해 반응의 온도 또한 영향을 받아 효소 활성 또는 대사 속도에 영향을 줄 수도 있고, 화합물 외에도 반응물이 효소를 저해하거나 유도해 이후 대사에 영향을 주는 정도에도 영향을 줄 수 있을 것이라 생각했습니다.

이외에도 제가 생각하지 못한 다양한 변수가 초기 화합물 농도에 의해 영향을 받을 수 있을 것이라 생각합니다.

혹시 초기 화합물 농도가 모두 같은지 실험 여건에 따라 모두 다른지의 여부를 알 수 있을까요?

로그인이 필요합니다
0 / 1000
DACON.SeungYoon
2023.09.20 10:56

안녕하세요, 이세의인공지능 님
주최측 답변을 전달드립니다:
언급해 주신 바와 같이 시험물질의 농도에 따라 대사 속도는 영향 받을 수 있습니다. 
효소와 반응속도와의 관계를 나타내는 Michaelis-Menten모델에서도 화학반응이
일정 농도 이상이 되면 평형점(equilibrium point)에 도달하는 것이 잘 알려져 있습니다.
초기 initial 구간의 cleran는 반응속도가 빠르므로  기질의 농도에 일반적으로 크게 영향을 받지 않지만,
그럼에도 기질농도가 과량이어서 일정한 한계속도에 접근하지 않도록 하기 위해,  2uM의 동일한 농도로 실험을 수행하였습니다.
또한 온도 조건도 반응에 매우 중요한 요소입니다. 
-80도에 보관하던 microsome을 4도에서 해동하여 대사활성을 잃지 않도록 준비한 후 37도에서의 반응이 최적의 상태로 일어날 수 있도록 수행하였습니다.
감사합니다.